Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.52■■■□□ 2
YIPF1Q9Y548 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YIPF1Q9Y548 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YIPF1Q9Y548 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YIPF1Q9Y548 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YIPF1Q9Y548 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
YIPF1Q9Y548 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YIPF1Q9Y548 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YIPF1Q9Y548 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms