Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH1Q9Y2L9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRCH1Q9Y2L9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LRCH1Q9Y2L9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRCH1Q9Y2L9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRCH1Q9Y2L9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms