Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC4Q9Y296 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC4Q9Y296 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC4Q9Y296 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms