Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GINS2Q9Y248 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GINS2Q9Y248 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GINS2Q9Y248 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GINS2Q9Y248 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINS2Q9Y248 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GINS2Q9Y248 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINS2Q9Y248 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GINS2Q9Y248 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GINS2Q9Y248 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms