Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS3Q9UNS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS3Q9UNS2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms