Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN11Q9UMQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN11Q9UMQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN11Q9UMQ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN11Q9UMQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN11Q9UMQ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN11Q9UMQ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN11Q9UMQ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN11Q9UMQ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN11Q9UMQ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN11Q9UMQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN11Q9UMQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms