Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA8BQ9ULN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNMA8BQ9ULN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA8BQ9ULN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA8BQ9ULN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8BQ9ULN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms