Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MKLN1Q9UL63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKLN1Q9UL63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKLN1Q9UL63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKLN1Q9UL63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms