Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PNMA2Q9UL42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PNMA2Q9UL42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PNMA2Q9UL42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PNMA2Q9UL42 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PNMA2Q9UL42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PNMA2Q9UL42 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA2Q9UL42 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms