Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT11Q9UKZ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT11Q9UKZ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT11Q9UKZ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT11Q9UKZ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms