Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTBP2Q9UKA9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTBP2Q9UKA9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTBP2Q9UKA9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTBP2Q9UKA9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTBP2Q9UKA9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTBP2Q9UKA9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTBP2Q9UKA9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTBP2Q9UKA9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms