Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNOT8Q9UFF9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNOT8Q9UFF9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNOT8Q9UFF9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNOT8Q9UFF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNOT8Q9UFF9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT8Q9UFF9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms