Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPG2Q9UBF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COPG2Q9UBF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPG2Q9UBF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.9 ms