Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SAE1Q9UBE0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SAE1Q9UBE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAE1Q9UBE0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAE1Q9UBE0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAE1Q9UBE0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAE1Q9UBE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms