Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUCLA2Q9P2R7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLA2Q9P2R7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUCLA2Q9P2R7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms