Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIN1Q9NXP7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GIN1Q9NXP7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIN1Q9NXP7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms