Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED9Q9NWA0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MED9Q9NWA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED9Q9NWA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED9Q9NWA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED9Q9NWA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms