Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVAQ9NVD7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARVAQ9NVD7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARVAQ9NVD7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARVAQ9NVD7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms