Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM30AQ9NV96 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM30AQ9NV96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM30AQ9NV96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM30AQ9NV96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM30AQ9NV96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM30AQ9NV96 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM30AQ9NV96 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms