Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATG3Q9NT62 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATG3Q9NT62 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATG3Q9NT62 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATG3Q9NT62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATG3Q9NT62 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
ATG3Q9NT62 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATG3Q9NT62 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATG3Q9NT62 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATG3Q9NT62 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms