Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA3Q9NST1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNPLA3Q9NST1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA3Q9NST1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms