Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOMER3Q9NSC5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOMER3Q9NSC5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOMER3Q9NSC5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms