Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CMC2Q9NRP2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC2Q9NRP2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMC2Q9NRP2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMC2Q9NRP2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMC2Q9NRP2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms