Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CD163L1Q9NR16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CD163L1Q9NR16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CD163L1Q9NR16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CD163L1Q9NR16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CD163L1Q9NR16 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CD163L1Q9NR16 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CD163L1Q9NR16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CD163L1Q9NR16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CD163L1Q9NR16 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CD163L1Q9NR16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CD163L1Q9NR16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CD163L1Q9NR16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD163L1Q9NR16 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CD163L1Q9NR16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD163L1Q9NR16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms