Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PRDM8Q9NQV8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM8Q9NQV8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM8Q9NQV8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM8Q9NQV8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms