Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERVK-5Q9HDB9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVK-5Q9HDB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-5Q9HDB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVK-5Q9HDB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVK-5Q9HDB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVK-5Q9HDB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-5Q9HDB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-5Q9HDB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-5Q9HDB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-5Q9HDB9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms