Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMURF2Q9HAU4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMURF2Q9HAU4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMURF2Q9HAU4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMURF2Q9HAU4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMURF2Q9HAU4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms