Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRKRIP1Q9H875 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRKRIP1Q9H875 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKRIP1Q9H875 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRKRIP1Q9H875 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PRKRIP1Q9H875 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKRIP1Q9H875 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
PRKRIP1Q9H875 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRKRIP1Q9H875 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRKRIP1Q9H875 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRKRIP1Q9H875 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms