Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB1BQ9H0U4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1BQ9H0U4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1BQ9H0U4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB1BQ9H0U4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1BQ9H0U4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms