Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD1Q9GZZ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD1Q9GZZ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD1Q9GZZ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD1Q9GZZ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms