Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLIRPQ9GZT3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLIRPQ9GZT3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLIRPQ9GZT3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms