Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
REXO4Q9GZR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
REXO4Q9GZR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REXO4Q9GZR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
REXO4Q9GZR2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
REXO4Q9GZR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms