Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDEL1Q9GZM8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDEL1Q9GZM8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDEL1Q9GZM8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDEL1Q9GZM8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms