Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF407Q9C0G0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF407Q9C0G0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF407Q9C0G0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF407Q9C0G0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF407Q9C0G0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF407Q9C0G0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF407Q9C0G0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms