Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM3Q9BZL3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM3Q9BZL3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM3Q9BZL3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM3Q9BZL3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms