Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
THUMPD2Q9BTF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
THUMPD2Q9BTF0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
THUMPD2Q9BTF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
THUMPD2Q9BTF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
THUMPD2Q9BTF0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
THUMPD2Q9BTF0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
THUMPD2Q9BTF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
THUMPD2Q9BTF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
THUMPD2Q9BTF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms