Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LARP6Q9BRS8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LARP6Q9BRS8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LARP6Q9BRS8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LARP6Q9BRS8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LARP6Q9BRS8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LARP6Q9BRS8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LARP6Q9BRS8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LARP6Q9BRS8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
LARP6Q9BRS8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
LARP6Q9BRS8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LARP6Q9BRS8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LARP6Q9BRS8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms