Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNS3Q9BQ31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNS3Q9BQ31 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNS3Q9BQ31 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms