Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms