Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LGMNQ99538 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGMNQ99538 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LGMNQ99538 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LGMNQ99538 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LGMNQ99538 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGMNQ99538 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms