Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TUBGCP6Q96RT7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TUBGCP6Q96RT7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
TUBGCP6Q96RT7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TUBGCP6Q96RT7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TUBGCP6Q96RT7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TUBGCP6Q96RT7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TUBGCP6Q96RT7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms