Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERGIC2Q96RQ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERGIC2Q96RQ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERGIC2Q96RQ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ERGIC2Q96RQ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERGIC2Q96RQ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERGIC2Q96RQ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms