Protein–RNA interactions for Protein: Q96PG1

MS4A4E, Putative membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4E, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4EQ96PG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A4EQ96PG1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A4EQ96PG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4EQ96PG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4EQ96PG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4EQ96PG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4EQ96PG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4EQ96PG1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4EQ96PG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms