Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC34Q96HJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC34Q96HJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC34Q96HJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC34Q96HJ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC34Q96HJ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms