Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXT2Q93063 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXT2Q93063 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXT2Q93063 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXT2Q93063 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXT2Q93063 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXT2Q93063 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EXT2Q93063 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms