Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LPPQ93052 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LPPQ93052 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LPPQ93052 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPPQ93052 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPPQ93052 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPPQ93052 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPPQ93052 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPPQ93052 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPPQ93052 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPPQ93052 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPPQ93052 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPPQ93052 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LPPQ93052 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LPPQ93052 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LPPQ93052 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPPQ93052 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPPQ93052 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LPPQ93052 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LPPQ93052 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPPQ93052 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPPQ93052 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPPQ93052 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
LPPQ93052 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LPPQ93052 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LPPQ93052 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPPQ93052 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPPQ93052 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPPQ93052 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPPQ93052 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPPQ93052 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPPQ93052 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPPQ93052 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPPQ93052 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPPQ93052 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPPQ93052 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPPQ93052 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPPQ93052 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPPQ93052 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPPQ93052 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LPPQ93052 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LPPQ93052 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LPPQ93052 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPPQ93052 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPPQ93052 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPPQ93052 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LPPQ93052 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LPPQ93052 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPPQ93052 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LPPQ93052 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPPQ93052 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPPQ93052 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPPQ93052 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LPPQ93052 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPPQ93052 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPPQ93052 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPPQ93052 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPPQ93052 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPPQ93052 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPPQ93052 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPPQ93052 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LPPQ93052 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LPPQ93052 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LPPQ93052 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPPQ93052 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPPQ93052 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPPQ93052 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LPPQ93052 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LPPQ93052 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LPPQ93052 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LPPQ93052 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPPQ93052 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPPQ93052 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LPPQ93052 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LPPQ93052 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LPPQ93052 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LPPQ93052 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LPPQ93052 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPPQ93052 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPPQ93052 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPPQ93052 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPPQ93052 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPPQ93052 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPPQ93052 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPPQ93052 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LPPQ93052 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LPPQ93052 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPPQ93052 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPPQ93052 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPPQ93052 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms