Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ2

HPSE2, Inactive heparanase-2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSE2Q8WWQ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPSE2Q8WWQ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPSE2Q8WWQ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPSE2Q8WWQ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPSE2Q8WWQ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPSE2Q8WWQ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPSE2Q8WWQ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPSE2Q8WWQ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPSE2Q8WWQ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms