Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC12Q8WVT3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC12Q8WVT3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC12Q8WVT3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC12Q8WVT3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC12Q8WVT3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms