Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX33Q8WV41 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX33Q8WV41 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX33Q8WV41 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX33Q8WV41 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms