Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA3

PSMA8, Proteasome subunit alpha type-7-like, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA8Q8TAA3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA8Q8TAA3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA8Q8TAA3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA8Q8TAA3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA8Q8TAA3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA8Q8TAA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA8Q8TAA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA8Q8TAA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA8Q8TAA3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA8Q8TAA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMA8Q8TAA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMA8Q8TAA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMA8Q8TAA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms